Em hospitais e clinicas os sistemas de climatização bem projetados, construídos e mantidos podem auxiliar no conforto do paciente e sua recuperação.

O ar condicionado de um hospital deve ser capaz de controlar as condições ambientais como temperatura e umidade e mitigar o risco de contaminação e infecções. O controle da contaminação é realizado com cascatas de pressão, ventilação por diluição (renovação de ar do ambiente) e sistemas de filtragem adequados e pela forma que o ar se movimenta no ambiente. Cada área de um hospital tem requisitos específicos e guias de projetos de entidades reconhecidas auxiliam no processo. Algumas das fontes que podem ser referenciadas são ASHRAE, OMS, CDC, ICCCS e normas nacionais e internacionais.